IN

LUGAR

TIEMPO

En general, se utiliza cuando el objeto o la persona se encuentran en un lugar o espacio delimitado (que está cerrado por los cuatro costados, que constituye un volumen):

I’m in the garden / my room / in the car.

The key is in my pocket / my bag /the box.

in (in) - en (para meses, estaciones, años y partes del día)

That monument was built in May / in 1893.
Ese monumento fue construido en mayo / en 1993.

También se utiliza con países, ciudades o calles, en este último caso en inglés británico:

I live in Paris / in Oxford Street

I study in the morning / afternoon / evening.
Yo estudio en la mañana / tarde / noche.

Existen algunas expresiones en las que la preposición in es obligatoria:

I will see you in two weeks.
Te veré en dos semanas.

ON

LUGAR

TIEMPO

Se utiliza cuando el objeto o la persona se encuentran en un lugar que constituye una superfície:

The book is on the table / the bed / the floor.

I’m on the plane / train / bus . (todos los transportes en inglés son superficies, excepto los coches)

on (on) - en (para los días - On Monday, On Tuesday,...etc.)

Everybody here goes to church on Sundays.
Todo el mundo aquí va a la iglesia los domingos. 

También utilizamos on cuando hablamos de los pisos de un edificio:

I live on the second floor.

The trial will be held on Tuesday morning.
El juicio se llevará a cabo el martes por la mañana.

·                     Existen algunas expresiones en las que la preposición on es obligatoria:

Bill celebrates his birthday on the 7th of July.
Bill festeja su cumpleaños el 7 de julio.

AT

LUGAR

TIEMPO

En general se utiliza para expresar la posición respecto a un punto de referencia:

He is waiting at the door / the bus stop / at the desk.

at (at) - a (se usa para la horas)

Everybody in the company has lunch at noon.
Todo el mundo en la empresa almuerza al mediodía.

La referencia también puede ser un evento:

We are meeting at the party / the match.

Bill gets up at 7 o'clock every morning.
Bill se levanta a las 7 todas las mañanas.

Existen algunas expresiones en las que la preposición at es obligatoria:

I left work at ten o'clock last night.
Me fui del trabajo a las 10 anoche.

Importante:

Con el verbo to arrive utilizamos at cuando se trata de llegar a un edifício (He arrived at the airport / at the office) e in cuando se trata de ciudades ( He arrived in London)

En algunos contextos, se puede utilizar tanto atcomo in, con alguna diferencia de significado:

I was at the cinema last night.(Fuí al cine para ver una película)

I was in the cinema last night. (Estuve dentro del edifício del cine, no necesariamente para ver una película)

I was at the office yesterday. (Fuí a la oficina para trabajar)

I was in the office yesterday. (Estuve en la oficina, no necesariamente para trabajar)